W systemie VAT Margin Scheme VAT jest płacony tylko od różnicy między ceną sprzedaży a ceną zakupu. System opiera się na dyrektywie UE 2006/112/WE. System jest stosowany na przykład w handlu towarami używanymi lub samochodami używanymi, gdy towary są kupowane od konsumenta i odsprzedawane. Program jest dobrowolny.